135 件の論文
システム生物学は、個々の遺伝子やタンパク質をバラバラに調べるのではなく、生命全体を一つの複雑なネットワークとして捉える学問です。まるでオーケストラの調和を理解するためには、一人ひとりの楽器の音だけでなく、全体が奏でる旋律に耳を澄ませるようなもので、この分野では生体内のあらゆる要素がどう相互作用し、命という現象を生み出しているのかを探求しています。
Gist.Science では、この分野の最先端の知見を bioRxiv から毎日収集し、専門家の手による詳細な解説と、誰でも読める平易な要約の両方を提供しています。最新の研究動向を素早く把握できるよう、私たちは bioRxiv に投稿されたすべての新プレプリントを処理し、その内容をわかりやすく整理してお届けします。
以下に、システム生物学の最新研究から厳選された論文リストをご紹介します。
この論文は、肝臓の体内時計によって制御される循環性代謝物であるニコチン酸リボシド（NaR）が、プレファンドリン複合体を介して小胞体ストレス応答と CEBPA の発現を調節し、時間依存的に脂肪細胞の分化と脂質蓄積を制御する新たな全身性時計メカニズムを解明したことを報告しています。
MoTrPAC コンソーシアムの初期研究は、健康な成人を対象とした急性および慢性の持久運動・筋力運動介入を通じて、運動がもたらす生理学的・分子レベルの適応メカニズムを解明するための基盤を確立したことを示しています。
本研究は、ニューラル事後推定を用いて、細胞移動のスパチオテンプラル確率モデルから尤度が計算不可能な場合でも、要約統計量や生データから直接生物学的に解釈可能なパラメータを推定するフレームワークを提案し、その有効性を検証したものである。
同位体標識を用いたマウスの研究により、加齢に伴う腎臓の線維化は、基底膜や線維性コラーゲンの分解能低下と構造変化が主要な原因であることが明らかになりました。
この論文は、多組織における急性持久運動とレジスタンス運動の時間的変化を包括的オミクス解析で追跡し、タンパク質コード配列を変更する多数の代替スプライシング事象を同定するとともに、運動反応におけるスプライシング調節の主要な役割を実証したものである。
本論文は、異なる仮定に基づくブールネットワーク制御ツールの結果の不一致を解消するため、制御問題の体系的分類と評価枠組みを提案し、複数のツールの予測を統合した「変異共発生スコア」を用いて、T-LGL 白血病の細胞死に関連する鍵となる変異を特定する手法を確立した。
本研究は、単一細胞解析技術を用いて、飢餓などのストレス履歴を持つ細菌が再活性化時に一時的な耐性状態を示し、これがβ-ラクタム系抗生物質の投与後の集団再生の主要な駆動力となることを明らかにし、最適な投与戦略の確立に貢献しました。
本論文は、流体力学と慣性の概念に基づいた「一般化形態形成理論（GMT）」を提唱し、この枠組みが分子から個体レベルまでの多様な散逸構造における動的パターンを統一的に記述し、12 の標準的な設計パターンへと集約できることを示しています。
この研究は、電子タバコ曝露がラットの炎症および凝固系を活性化させることを示し、高用量のビタミン D 補給がこれらの有害な影響を軽減し、ニコチン依存の低下にも寄与する可能性を明らかにしました。
この論文は、メタン生成阻害剤と補因子F430の結合特性を解明し、機械学習と代謝モデリングを統合した多段階ワークフローを開発することで、反芻動物の腸内発酵を阻害せず、かつ実用的なメタン削減剤を合理的に設計するための基盤を確立したものである。